Organem zarządzającym Caritas Diecezji Tarnowskiej jest Zarząd Caritas. Organem nadzoru i kontroli Caritas jest Komisja Rewizyjna.
Skład Zarządu Caritas jest dwuosobowy: Dyrektor oraz Członek Zarządu – Sekretarz, powoływani przez Biskupa Tarnowskiego.
Do zadań Zarządu Caritas należy w szczególności:
- organizowanie przewidzianych Statutem działań Caritas, w tym poprzez uchwalanie uchwał;
- opracowywanie programów pracy Caritas oraz programów jednostekterenowych;
- uchwalanie budżetu oraz przygotowanie i zatwierdzanie sprawozdań a także bilansów;
- uchwalanie uchwał w zakresie prowadzonej przez Caritas nieodpłatnej oraz odpłatnej działalności pożytku publicznego w poszczególnych jednostkach;
- gospodarowanie funduszami i majątkiem Caritas;
- organizowanie systematycznych zebrań, celem omówienia bieżących spraw;
- przygotowywanie programów rocznej działalności Caritas.